分子間互作的5大實驗方法：①蛋白質-蛋白質   ②蛋白質-RNA   ③蛋白質-DNA   ④蛋白質-DNA/RNA     ⑤RNA-DNA

 

 

一、蛋白質-蛋白質

1.免疫沉淀（IP）

 

 

2.免疫共沉淀(co-IP)

 

 

3.GST pull-down

 

 

4.co-IP 和GST pull-down區(qū)別

①co-IP：研究的是體內自然狀態(tài)下的蛋白質互相作用，反應的是比較真實的蛋白質相互作用，由于沉淀下來的是蛋白質復合物，不能顯示蛋白質之間的相互作用是直接還是間接的。

 

 

②GST pull down：可以確定目的蛋白和檢測蛋白是否發(fā)生直接相互作用，但是無法得知體內真實的結合情況；

 

 

 

 

二、蛋白質-RNA

1.蛋白質與RNA相互作用

①RNA結合蛋白

RNA結合蛋白

微小RNA結合蛋白（如，Ago2）

②RNA

mRNA、lncRNA、circRNA、micRNA

 

 

③RIP：以蛋白為主角，研究RNA與蛋白的互作

 

 

④RNA pulldown：以RNA為主角，研究其與蛋白的互作

 

  

2、RNA結合蛋白免疫沉淀技術(RIP)

 

 

3.RNA pull down

 

 

 

三、蛋白質-DNA

染色質免疫共沉淀技術(ChIP)

體內研究DNA與蛋白質作用反應細胞內轉錄因子與啟動子Promoter的結合情況。

 

 

 

四、蛋白質-DNA/RNA

凝膠遷移或電泳遷移率實驗(EMSA)

 

 

五、熒光素酶實驗

1.啟動子活性研究

 

 

 

2.基因3’UTR區(qū)和microRNA結合實驗