利用LC-MS/MS技術鑒定單一膠條(SDS-PAGE)、IP/Co-IP/Pull-down純化溶液等中等復雜樣本的蛋白。
Insect Sci. 2012. 12: p. 18. Nature reviews Molecular cell biology, 2007. 8(8): p. 645-654.
混合物鑒定
基礎類產品:適用于中等復雜的樣本,鑒定結果可以作為研究蛋白互作的數據基礎
儀器性能優良:基于高分辨率(大于105)、高質量精度(小于1ppm)質譜平臺,可獲得更加準確的結果
鑒定數:一般可鑒定10~300種蛋白
信息分析內容
數據產出統計
蛋白質鑒定結果
蛋白質GO分析
蛋白質COG分析
蛋白質Pathway代謝通路分析
混合物樣本:≥30μg,濃度≥1μg/μl
膠條樣本:考染或銀染條帶肉眼可見,條帶清晰。銀染膠不能含有戊二醛,且須在電泳后一周內切膠送樣
Q Exactive, Thermo TripleTOF 5600,AB SCIEX
LTQ Orbitrap velos, Thermo
Methoprene and temperature effects on caste differentiation and protein composition in the Formosan subterranean termite, Coptotermesformosanus
J Insect Sci. 2012;12:18. doi: 10.1673/031.012.1801.
研究內容:
本次研究通過LC-MS/MS鑒定SDS-PAGE分離的蛋白,鑒定溫度變化和甲氧普林處理后蛋白水平的變化,研究其對白蟻等級分化的影響。
研究路線:
樣本:乳白蟻,分別經5種溫度(20, 23, 25, 28, 31℃)處理,以及有無甲氧普林處理。
技術:SDS-PAGE分離蛋白,切取膠條進行質譜鑒定,并結合N端測序和凝膠觀察結果,計算蛋白表達量,統計分析差異蛋白。
研究結果:
白蟻等級分化過程受到溫度變化的調控,較高溫度環境中,能更快地從工蟻發育成兵蟻
通過膠條鑒定和N端測序發現了多種蛋白應激變化,特別是這4種蛋白:Hexamerin-1,Hexamerin-2,Endo-beta 1, 4 glucanase和myosin
其中蛋白Hexamerin-2,Endo-beta 1, 4 glucanase和myosin的表達受溫度、監測時間和保幼激素甲氧普林的影響。而Hexamerin-1主要表現對溫度和監測時間的依賴效應
實驗結果有利于理解控制白蟻分化的一系列復雜因素以及給消滅白蟻時提高保幼激素利用效率提供參考數據